Varian gen yang baru diidentifikasi bisa

urutan genetik tercermin dalam kacamata penelitianBagikan di Pinterest Studi asosiasi genom terbesar yang pernah ada mengungkap wawasan baru mengenai risiko diabetes tipe 2 Kredit gambar: TEK IMAGE/SCIENCE PHOTO LIBRARY/Getty Images.Faktor risiko diabetes tipe 2 berasal dari lingkungan dan genetik, dan sejauh ini para peneliti telah mengidentifikasi banyak faktor risiko genetik. Namun kini, studi asosiasi genom terbesar terhadap penderita diabetes tipe 2 hingga saat ini telah menemukan lebih banyak lokasi varian risiko dibandingkan sebelumnya. Penelitian ini juga mengidentifikasi berbagai kelompok varian yang berkontribusi terhadap risiko pengembangan penyakit dan mengungkapkan lebih banyak tentang berbagai mekanisme yang mendasari penyakit ini.

Studi asosiasi genom telah dimungkinkan sejak genom manusia pertama kali diurutkan pada tahun 2003. Mereka memungkinkan kita memahami wilayah genom dan varian genetik mana yang dikaitkan dengan peningkatan risiko kondisi tertentu.

Ditambah dengan munculnya peta seluler dan perpustakaan genom, kini para peneliti tidak hanya dapat mengidentifikasi varian yang mungkin berdampak pada risiko, tetapi juga memahami apa yang mereka kendalikan dan mekanisme seluler yang berperan.

Jadi, apa yang dapat diajarkan oleh penanda genetik kepada kita tentang penyakit yang tersebar luas seperti diabetes tipe 2? Hal itulah yang dilakukan para ilmuwan dalam studi barunya – yang hasilnya kini mulai muncul Alam — berangkat untuk mengungkapkan.

Diabetes tipe 2 ditandai dengan berkurangnya sensitivitas sel terhadap insulin, yang berarti sel kurang mampu menyerap glukosa dalam aliran darah.

Hal ini menyebabkan peningkatan kadar glukosa (gula) darah secara kronis, yang dapat meningkatkan risiko komplikasi seperti penyakit kardiovaskular dan kerusakan saraf.

Ada banyak faktor risiko yang diketahui untuk diabetes tipe 2, antara lain anggota keluarga yang mengidapnya, keturunan Afrika atau Asia, tekanan darah tinggi, obesitas, dan sindrom ovarium polikistik (PCOS).

Studi asosiasi genom telah mengungkapkan beberapa hubungan menarik lainnya antara diabetes tipe 2 dan kondisi lainnya. Misalnya, sebuah penelitian pada tahun 2023 menunjukkan bahwa sejumlah varian risiko genetik juga dimiliki oleh diabetes tipe 2 dan gejala depresi.

Inga Prokopenko, yang mempelajari pengaruh genetika terhadap diabetes dan kontrol glikemik dari University of Surrey, mengatakan Berita Medis Hari Ini bahwa pandangan tentang diabetes tipe 2 telah berubah dalam beberapa tahun terakhir:

“Poin terakhir yang sangat penting adalah banyaknya GWAS besar sebelumnya [genome-wide association studies] meta-analisis pada diabetes tipe 2 fokus pada [type 2 diabetes] sebagai hasilnya, tetapi jelas bahwa sebagai [type 2 diabetes]seiring perkembangan penyakit, ada banyak komplikasi penyakit ini. Komplikasi besar ini sangat penting, seperti nefropati diabetik, retinopati, dll.”

Sebuah penelitian yang baru-baru ini diterbitkan di Alam adalah studi asosiasi genom diabetes tipe 2 terbesar hingga saat ini dan mencakup data genom dari 2.535.601 individu, 428.452 di antaranya menderita diabetes tipe 2.

Banyak penelitian asosiasi genom mencakup data dari kumpulan data Eropa yang didominasi kulit putih, namun penelitian ini mencakup data dari enam kelompok leluhur, yaitu: Eropa, Asia Timur, Afrika Amerika, Asia Selatan, Afrika Selatan, dan Hispanik dengan Amerika, Afrika Barat, dan kelompok Eropa. asal.

Namun, mayoritas peserta masih didominasi oleh keturunan Eropa, dengan 60% dari kelompok tersebut adalah kelompok ini.

Sebuah konsorsium peneliti global menemukan 1.289 varian genetik di 611 wilayah genom yang dikenal sebagai lokus, 145 di antaranya merupakan penemuan baru.

Mereka kemudian memetakan varian tersebut ke 37 fenotip kardiometabolik, termasuk rasio tinggi pinggang, persentase lemak hati, kolesterol LDL dan HDL, tekanan darah, insulin puasa, dan lainnya, untuk melihat apakah varian tertentu dikaitkan dengan fenotipe atau sifat tertentu.

Mereka kemudian mengidentifikasi delapan “cluster” yang tidak tumpang tindih yang ditandai dengan subset varian yang terkait dengan sifat kardiometabolik tertentu.

Kelompok-kelompok ini antara lain mencakup disfungsi sel beta, obesitas, dan metabolisme hati dan lipid (lemak), dan juga mengkarakterisasi apakah orang-orang dengan kelompok ini menunjukkan peningkatan atau penurunan sekresi insulin atau peningkatan atau penurunan sensitivitas insulin.

Salah satu penulis koresponden, Dr. Benjamin F. Voight, dari Fakultas Kedokteran Universitas Pennsylvania-Perelman, mengatakan tidak sedikit itu “[i]Ternyata varian genetik yang berkontribusi pada kelompok kami tidak tumpang tindih [with] satu sama lain – sehingga risiko penyakit pasien pada tingkat yang berbeda-beda dipengaruhi oleh kelompok-kelompok ini.’

Selanjutnya, para peneliti melihat apakah delapan kelompok yang mereka identifikasi dapat digunakan untuk memprediksi hasil penyakit kardiovaskular pada para peserta.

Mereka mengembangkan skor poligenik untuk 279.552 individu tambahan yang data genomnya mereka miliki, termasuk 30.288 penderita diabetes tipe 2, dan memeriksa apakah ada hubungan dengan hasil kardiovaskular dan kelompok varian genetik.

Asosiasi paling signifikan yang ditemukan menunjukkan bahwa risiko rawat inap karena gagal jantung meningkat sebesar 15% pada orang yang positif mengidap kelompok varian genetik obesitas.

Mereka juga menemukan bahwa sekelompok varian genetik sel beta proinsulin positif mengurangi risiko rawat inap karena gagal jantung sebesar 10%. Cluster ini juga dikaitkan dengan risiko kematian kardiovaskular yang 10% lebih rendah dan risiko kejadian kardiovaskular utama dan serangan jantung yang 6% lebih rendah.

Dr Voight berkata:

“Saya pikir pintu gerbang potensial yang terbuka untuk jenis pekerjaan ini adalah di mana seseorang dapat mulai membedah bagaimana ‘subtipe’ genetik diabetes tipe 2 yang berbeda dapat memodulasi risiko komplikasi diabetes—baik sedikit atau banyak. Selain itu, subtipe genetik juga dapat memberi kita petunjuk yang lebih baik tentang gen yang mendasari dan biologi yang paling berkontribusi terhadap komplikasi ini.”

Prokopenko, yang tidak terlibat dalam penelitian tersebut, mengatakan hal ini mewakili kemajuan signifikan dalam analisis kumpulan data besar dan telah meningkatkan jumlah varian risiko yang kita ketahui sebanyak seperempatnya.

“Ini adalah sumber daya yang penting bagi kami para ilmuwan dan akan memungkinkan banyak penelitian lanjutan, eksperimen, dll., dan lebih banyak penemuan obat,” katanya. tidak sedikit.

“Hasil penelitian ini dan informasi yang diperoleh akan memungkinkan kita untuk meningkatkan kehidupan penderita diabetes dengan pengobatan baru, cara perawatan baru, cara baru. [treating] ini di masa depan melalui prediksi kerentanan individu atau kemampuan untuk membedakan subtipe diabetes yang potensial,” kata Prof. Prokopenko.

You May Also Like

More From Author

+ There are no comments

Add yours